Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí

Autoři

  • Jakub Faktor Ústav biochemie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno
  • Iva Struhárová Ústav biochemie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno | Regionální centrum aplikované a molekulární onkologie, Masarykův onkologický ústav, Brno
  • Alena Fučíková Ústav molekulární patologie, Fakulta vojenského zdravotnictví, Univerzita obrany, Hradec Králové
  • Martin Hubálek Ústav molekulární patologie, Fakulta vojenského zdravotnictví, Univerzita obrany, Hradec Králové
  • Bořivoj Vojtěšek Regionální centrum aplikované a molekulární onkologie, Masarykův onkologický ústav, Brno
  • Pavel Bouchal Ústav biochemie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno | Regionální centrum aplikované a molekulární onkologie, Masarykův onkologický ústav, Brno

Klíčová slova:

kvantifikace proteinů, hmotnostní spektrometrie, proteomika

Abstrakt

Selected reaction monitoring (SRM) is a quantitative MS-based method which recently expanded to analysis of proteins by determination of peptides. The instrumentation consists of a nanoflow liquid chromatograph coupled with nanoelectrospray ionization and a triple-quadrupole mass spectrometer. In principle, the first quadrupole works as a mass filter, transmitting only a selected peptide, which is fragmented in a second quadupole via collision-induced dissociation. The third quadrupole transmits the selected peptide fragments, which are then directed to the detector. This approach enables targeted quantification of tens of proteins in a single analysis with very good sensitivity and selectivity. The SRM becomes a key method in a new targeted-proteomics toolbox. The most important field of its applications lies in the life sciences research where SRM enables fast, accurate and cost-effective determination of proteins in large sets of samples.

Stahování

Publikováno

15.11.2011

Jak citovat

Faktor, J., Struhárová, I., Fučíková, A., Hubálek, M., Vojtěšek, B., & Bouchal, P. (2011). Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí. Chemické Listy, 105(11), 846–850. Získáno z http://ww-w.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/1027

Číslo

Sekce

Články